A APECI foi fundada no dia 9 de Fevereiro de 1979, por um grupo de pais que sentiu uma profunda injustiça e a marginalização a que estavam vetados os seus filhos deficientes mentais, a quem eram negados os direitos fundamentais de qualquer criança (à educação, à reabilitação, ao convívio, à alegria, à felicidade e essencialmente à integração social), direitos esses considerados na Constituição da República. Criada com o objectivo de responder às necessidades da deficiência mental na região norte do Distrito de Lisboa, que abrangia cinco Concelhos: Torres Vedras; Mafra; Sobral de Monte Agraço; Cadaval e Alenquer.

Depois de celebrado o acordo com o Ministério da Educação e com o apoio da Fundação Calouste Gulbenkian, a Associação começou a trabalhar com 35 crianças dos 5 aos 15 anos, como Escola de Ensino Especial. Desde inicio conseguiu a compreensão das Instituições mais representativas da Comunidade: a Igreja, a Câmara Municipal de Torres Vedras e restantes Autarquias, as Escolas e Associações de Pais, o Hospital e o Centro de Saúde, os diversos meios de Comunicação Social local, bem como de muitas empresas e colectividades.

A Associação Para a Educação de Cianças Inadaptadas de Torres Vedras foi registada como Instituição Particular de Solidariedade Social em 23 de Outubro de 1981, no Centro Regional de Segurança Social de Lisboa.

Iniciou a sua actividade em 1979 apenas com a Valência de Ensino Especial, mas nos anos seguintes começou a diversificar o seu âmbito de atendimento, a saber:
  

• 1986 - Área de Formação e Integração Profissional: As crianças iam crescendo e havia necessidade de dar uma resposta diversificada às suas necessidades. Começou cedo a Associação a sensibilizar o meio empresarial e outras actividades económicas para as capacidades produtivas de muitos dos seus jovens, devidamente treinados e enquadrados nos meios laborais normais. De forma pragmática e informal integrou mais de uma dezena de jovens, com sucesso reconhecido. Por isso, foi comunicada a concorrer às verbas do Fundo Social Europeu, com um projecto de Formação Profissional, através do Instituto de Emprego e Formação Profissional. Numa quinta perto de Torres Vedras, na Freguesia de Runa, em parte doada (3 hectares) e em parte adquirida pela Associação (outros 3 hectares), iniciou-se a Formação profissional, agora com outras possibilidades e meios, em diversas áreas, com uma média de 40 formandos por ano. Os estágios laborais e as integrações nos meios normais de trabalho incrementaram-se extraordináriamente sempre com grande receptividade da parte das empresas e serviços.

• 1988 - Centro de Actividades Ocupacionais: Entretanto, uma nova população de utentes mudou  de características. Tinhamos agora um maior número de crianças e jovens com quadros graves de deficiência mental e física e grande dependência. Com a celebração de um Acordo Atípico com a Segurança Social, foi possível implementar uma área de Apoio Ocupacional para aqueles jovens que ultrapassavam a idade da escolaridade obrigatória e não tinham condições para serem integrados na Formação Profissional.

• 1988 - Valência de Serviço de Apoio Técnico Precoce: Preocupava-nos a necessidade de acompanhar as crianças e suas famílias desde o momento do seu nascimento, ajudando a acolhê-los, a valorizar as suas capacidades e a superar as suas carências, além do horizonte de esperança à compreensão e aceitação da diferença que tanto pode enriquecer as suas vidas. Implementámos, pois, a Valência de Intervenção Precoce. Esta funcionava num pavilhão pré-fabricado montado no recreio, por não dispormos de espaço no Centro. Este Pavilhão foi oferecido pela Associação de Solidariedade Social D. Pedro V. Neste momento funciona em gabinetes (para cada área de intervenção) da Instituição. Foi realizado um Acordo Atípico com a Segurança Social para este fim.
  
   
• 1989 - Inauguração do Centro Actual:

• 1994 - Lar Residencial "A Nossa Casa": Mais uma conquista da Associação foi conseguir pôr em funcionamento uma Residência, com capacidade para 12 utentes, em dois andares que comprou, numa urbanização próxima da sede, na Cidade de Torres Vedras. Começa assim a dar uma pequena resposta, que foi ampliada 6 anos mais tarde, à grande angustia dos pais sobre o futuro dos seus filhos. Nela vivem permanentemente ou temporariamente, alguns orfãos e outros jovens cujas famílias se encontram incapacitadas para os cuidarem por razões físicas ou psíquicas. Também nesta Valência a Associação tem conseguido despertar a solidariedade do meio, através de um "CLUBE DE AMIGOS", que ajuda a completar o financiamento que advém do Acordo de Cooperação com a Segurança Social. 
  
  
  
• 2000 - Inauguração de Novas Instalações da Área de Residência: Funciona em duas vivendas situadas junto à Sede da Instituição, com capacidade para 20 utentes.

• 2006 - Inauguração de Novas Instalações da Formação Profissional:
  
                        
  
   
• 2009/2010 - Centro de Recursos para a Inclusão: Disponibiliza recursos da Instituição, enquadrados num plano de acção em cooperação com o Ministério da Educação e parceria da C.M.T.V., para apoio à inclusão no ensino regular de alunos do 1ºe 2º ciclos com necessidades educativas especiais de carácter permanente. As actividades terapêuticas e pedagógicas são desenvolvidas nos próprios agrupamentos do concelho e nas instalações da A.P.E.C.I. (CAO e FP).

Tipo de Área/Valência de Atendimento	Nº de Utentes
Serviço de Apoio Técnico Precoce	48
Valência Sócio-Educativa	26
Centro de Actividades Ocupacionais	76
Área de Formação e Integração Profissional	76
Lar Residencial	27
Centro de Recursos para a Inclusão (C.R.I.)	356
Total	609